Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TYRO3Q06418 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms