Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCNT1Q02742 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms