Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2A1P52655 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2A1P52655 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms