Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUFMP49411 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUFMP49411 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TUFMP49411 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms