Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIA1P42261 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms