Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP1P29466 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.8 ms