Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ZBED1O96006 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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