Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIN3BO75182 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms