Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CLDN34H7C241 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN34H7C241 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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