Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMX2A2RU54 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms