Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNPO3Q9Y5L0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms