Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms