Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KCTD12Q96CX2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms