Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL2Q6F5E8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms