Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms