Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM259Q4ZIN3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms