Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTXN3Q4LDR2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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