Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms