Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SSX1Q16384 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SSX1Q16384 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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SSX1Q16384 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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