Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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