Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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