Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SRSF6Q13247 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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