Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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