Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms