Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSRP1Q08945 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms