Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms