Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OTUD4Q01804 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms