Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF5P84085 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARF5P84085 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF5P84085 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF5P84085 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF5P84085 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF5P84085 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF5P84085 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARF5P84085 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms