Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KLF12Q9Y4X4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms