Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TPRKBQ9Y3C4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms