Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTF2Q9UNY4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms