Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MBD1Q9UIS9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MBD1Q9UIS9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms