Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-5Q9HDB9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms