Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM3Q9BZL3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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