Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRRC17Q8N6Y2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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