Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BHLHA9Q7RTU4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms