Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP13-3Q3SY46 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms