Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HIST3H3Q16695 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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