Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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VAMP3Q15836 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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