Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NPTX1Q15818 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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