Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERC3Q15034 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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