Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FAM53BQ14153 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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