Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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