Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CBX3Q13185 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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