Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
STX4Q12846 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.02■□□□□ -0
STX4Q12846 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
STX4Q12846 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms