Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PUDPQ08623 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms