Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms