Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms