Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRB2P47870 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms