Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP1P29466 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CASP1P29466 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms